خبریں

امیونو تھراپی نے مہلک رسولیوں کے علاج میں انقلابی تبدیلیاں لائی ہیں، لیکن اب بھی کچھ مریض ایسے ہیں جو فائدہ نہیں اٹھا سکتے۔ لہذا، مؤثریت کو زیادہ سے زیادہ کرنے اور غیر ضروری زہریلے پن سے بچنے کے لیے، امیونو تھراپی کی تاثیر کا اندازہ لگانے کے لیے طبی ایپلی کیشنز میں مناسب بائیو مارکر کی فوری ضرورت ہے۔

ایف ڈی اے سے منظور شدہ بائیو مارکر

PD-L1 اظہار۔ امیونو ہسٹو کیمسٹری (IHC) کے ذریعہ PD-L1 اظہار کی سطحوں کی تشخیص سے ٹیومر تناسب سکور (TPS) حاصل ہوتا ہے، جو ٹیومر کے خلیات کے زندہ رہنے میں کسی بھی شدت کے جزوی یا مکمل طور پر جھلی کے داغ دار ٹیومر سیلز کا فیصد ہے۔ کلینیکل ٹرائلز میں، یہ ٹیسٹ پیمبرولیزوماب کے ساتھ ایڈوانسڈ نان سمال سیل پھیپھڑوں کے کینسر (NSCLC) کے علاج کے لیے ایک معاون تشخیصی ٹیسٹ کے طور پر کام کرتا ہے۔ اگر نمونے کا TPS ≥ 1% ہے، PD-L1 اظہار سمجھا جاتا ہے۔ TPS ≥ 50% PD-L1 کے اعلی اظہار کی نشاندہی کرتا ہے۔ ابتدائی فیز 1 ٹرائل (KEYNOTE-001) میں، PD-L1 TPS> 50% ذیلی گروپ میں pembrolizumab کا استعمال کرنے والے مریضوں کے ردعمل کی شرح 45.2% تھی، جبکہ TPS سے قطع نظر، یہ مدافعتی چیک پوائنٹ انحیبیٹر (ICI) علاج حاصل کرنے والے تمام مریضوں کے ردعمل کی شرح 19.4% تھی۔ بعد کے مرحلے 2/3 ٹرائل (KEYNOTE-024) نے PD-L1 TPS> 50% والے مریضوں کو تصادفی طور پر پیمبرولیزوماب اور معیاری کیموتھراپی حاصل کرنے کے لیے تفویض کیا، اور نتائج نے پیمبرولیزوماب علاج حاصل کرنے والے مریضوں میں مجموعی طور پر بقا (OS) میں نمایاں بہتری ظاہر کی۔

تاہم، ICI ردعمل کی پیشن گوئی کرنے میں PD-L1 کا اطلاق مختلف عوامل سے محدود ہے۔ سب سے پہلے، کینسر کی مختلف اقسام کے لیے بہترین حد مختلف ہوتی ہے۔ مثال کے طور پر، Pabolizumab استعمال کیا جا سکتا ہے جب گیسٹرک کینسر، غذائی نالی کے کینسر، مثانے کے کینسر کے کینسر اور پھیپھڑوں کے کینسر کے مریضوں میں ٹیومر PD-L1 کا اظہار بالترتیب 1%، 10% اور 50% ہو۔ دوم، PD-L1 اظہار کی سیل آبادی کا اندازہ کینسر کی قسم کے لحاظ سے مختلف ہوتا ہے۔ مثال کے طور پر، سر اور گردن کے بار بار ہونے والے یا میٹاسٹیٹک اسکواومس سیل کارسنوما کے علاج کے لیے FDA سے منظور شدہ ٹیسٹنگ کا دوسرا طریقہ، جامع مثبت سکور (CPS) استعمال کرنے کا انتخاب کیا جا سکتا ہے۔ تیسرا، مختلف کینسروں اور ICI ردعمل میں PD-L1 اظہار کے درمیان تقریباً کوئی تعلق نہیں ہے، جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ ٹیومر کا پس منظر ICI بائیو مارکر کی پیشن گوئی کرنے میں ایک اہم عنصر ہو سکتا ہے۔ مثال کے طور پر، CheckMate-067 ٹیسٹ کے نتائج کے مطابق، میلانوما میں PD-L1 اظہار کی منفی پیش گوئی کی قدر صرف 45% ہے۔ آخر میں، متعدد مطالعات سے پتہ چلا ہے کہ PD-L1 اظہار ایک ہی مریض میں ٹیومر کے مختلف گھاووں میں متضاد ہے، یہاں تک کہ ایک ہی ٹیومر کے اندر بھی۔ خلاصہ یہ کہ، اگرچہ NSCLC کے ابتدائی کلینیکل ٹرائلز نے PD-L1 اظہار پر ممکنہ پیش گوئی کرنے والے بائیو مارکر کے طور پر تحقیق کا اشارہ کیا، لیکن کینسر کی مختلف اقسام میں اس کی طبی افادیت غیر واضح ہے۔

ٹیومر اتپریورتن بوجھ. ٹیومر میوٹیشن برڈن (ٹی ایم بی) کو ٹیومر امیونوجنیسیٹی کے متبادل اشارے کے طور پر استعمال کیا گیا ہے۔ KEYNOTE-158 کے کلینیکل ٹرائل کے نتائج کے مطابق، پیمبرولیزوماب کے ساتھ علاج کیے جانے والے 10 قسم کے ایڈوانسڈ ٹھوس ٹیومر میں سے، کم از کم 10 میوٹیشن فی میگا بیس (ہائی ٹی ایم بی) والے مریضوں کی رسپانس کی شرح کم ٹی ایم بی والے مریضوں کی نسبت زیادہ تھی۔ یہ بات قابل غور ہے کہ اس تحقیق میں، TMB PFS کا پیش خیمہ تھا، لیکن یہ OS کی پیش گوئی کرنے سے قاصر تھا۔

مدافعتی تھراپی کا ردعمل بنیادی طور پر نئے اینٹیجنز کی ٹی سیل کی شناخت کے ذریعے چلتا ہے۔ اعلی ٹی ایم بی کے ساتھ منسلک مدافعتی صلاحیت بھی مختلف عوامل پر منحصر ہے، بشمول ٹیومر کی طرف سے پیش کردہ ٹیومر نیواینٹیجن؛ مدافعتی نظام ٹیومر neoantigens کو پہچانتا ہے۔ اینٹیجن سے متعلق مخصوص ردعمل شروع کرنے کی میزبان کی صلاحیت۔ مثال کے طور پر، اعداد و شمار سے پتہ چلتا ہے کہ کچھ مدافعتی خلیوں کی سب سے زیادہ دراندازی کے ساتھ ٹیومر درحقیقت روکنے والے ریگولیٹری ٹی سیل (ٹریگ) کلون ایمپلیفیکیشن کے حامل ہو سکتے ہیں۔ اس کے علاوہ، TMB کی رینج TMB neoantigens کی صلاحیت سے مختلف ہو سکتی ہے، کیونکہ اتپریورتن کی صحیح جگہ بھی ایک اہم کردار ادا کرتی ہے۔ وہ تغیرات جو اینٹیجن پریزنٹیشن کے مختلف راستوں میں ثالثی کرتے ہیں وہ مدافعتی نظام میں نئے اینٹیجنز کی پیش کش (یا غیر پیش کش) کو متاثر کر سکتے ہیں، جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ زیادہ سے زیادہ ICI ردعمل پیدا کرنے کے لیے ٹیومر کی اندرونی اور امیونولوجیکل خصوصیات کا ہم آہنگ ہونا ضروری ہے۔

فی الحال، TMB کو اگلی نسل کی ترتیب (NGS) کے ذریعے ماپا جاتا ہے، جو مختلف اداروں (اندرونی) یا استعمال ہونے والے تجارتی پلیٹ فارمز میں مختلف ہو سکتا ہے۔ NGS میں پوری ایکسوم سیکوینسنگ (WES)، پوری جینوم کی ترتیب، اور ٹارگٹڈ سیکوینسنگ شامل ہے، جو ٹیومر ٹشو اور گردش کرنے والے ٹیومر DNA (ctDNA) سے حاصل کی جا سکتی ہے۔ یہ بات قابل غور ہے کہ ٹیومر کی مختلف اقسام میں ٹی ایم بی کی ایک وسیع رینج ہوتی ہے، جس میں امیونوجینک ٹیومر جیسے میلانوما، این ایس سی ایل سی، اور اسکواومس سیل کارسنوما میں ٹی ایم بی کی سطح سب سے زیادہ ہوتی ہے۔ اسی طرح، مختلف ٹیومر کی اقسام کے لیے ڈیزائن کیے گئے پتہ لگانے کے طریقوں میں TMB تھریشولڈ ویلیوز کی مختلف تعریفیں ہیں۔ NSCLC، میلانوما، urothelial carcinoma، اور چھوٹے خلیے کے پھیپھڑوں کے کینسر کے مطالعہ میں، یہ پتہ لگانے کے طریقے مختلف تجزیاتی طریقے استعمال کرتے ہیں (جیسے متعلقہ جینوں کی مخصوص تعداد کے لیے WES یا PCR کا پتہ لگانا) اور حدیں (TMB زیادہ یا TMB کم)۔

مائیکرو سیٹلائٹس انتہائی غیر مستحکم ہیں۔ مائیکرو سیٹلائٹ انتہائی غیر مستحکم (MSI-H)، ICI ردعمل کے لیے پین کینسر بائیو مارکر کے طور پر، مختلف کینسروں میں ICI کی افادیت کی پیش گوئی کرنے میں بہترین کارکردگی کا حامل ہے۔ MSI-H مماثلت کی مرمت کے نقائص (dMMR) کا نتیجہ ہے، جس کی وجہ سے تبدیلی کی اعلی شرح ہوتی ہے، خاص طور پر مائیکرو سیٹلائٹ علاقوں میں، جس کے نتیجے میں بڑی تعداد میں نئے اینٹیجنز کی پیداوار ہوتی ہے اور بالآخر کلونل مدافعتی ردعمل کو متحرک کرتا ہے۔ ڈی ایم ایم آر کی وجہ سے زیادہ اتپریورتن بوجھ کی وجہ سے، MSI-H ٹیومر کو ہائی میوٹیشن بوجھ (TMB) ٹیومر کی ایک قسم کے طور پر سمجھا جا سکتا ہے۔ KEYNOTE-164 اور KEYNOTE-158 کے کلینیکل ٹرائل کے نتائج کی بنیاد پر، FDA نے Pembrolizumab کو MSI-H یا dMMR ٹیومر کے علاج کے لیے منظور کیا ہے۔ یہ پین کینسر کی پہلی دوائیوں میں سے ایک ہے جسے FDA نے منظور کیا ہے جو کہ ہسٹولوجی کے بجائے ٹیومر بائیولوجی سے چلتی ہے۔

اہم کامیابی کے باوجود، MSI سٹیٹس استعمال کرتے وقت آگاہ رہنے کے لیے مسائل بھی ہیں۔ مثال کے طور پر، dMMR کولوریکٹل کینسر کے 50% تک مریضوں کا ICI علاج کے لیے کوئی ردعمل نہیں ہے، جو ردعمل کی پیش گوئی میں دیگر خصوصیات کی اہمیت کو اجاگر کرتا ہے۔ ٹیومر کی دیگر اندرونی خصوصیات جن کا موجودہ پتہ لگانے والے پلیٹ فارمز کے ذریعہ اندازہ نہیں کیا جاسکتا ہے وہ عوامل میں حصہ لے سکتے ہیں۔ مثال کے طور پر، ایسی اطلاعات ملی ہیں کہ ڈی این اے کے علاقے میں پولیمریز ڈیلٹا (POLD) یا پولیمریز ε (POLE) کے اہم اتپریرک ذیلی یونٹس کو انکوڈنگ کرنے والے جینوں میں تغیر پذیر ہونے والے مریضوں میں نقل کی وفاداری کی کمی ہوتی ہے اور وہ اپنے ٹیومر میں "سپر میوٹیشن" فینو ٹائپ کی نمائش کرتے ہیں۔ ان میں سے کچھ ٹیومر نے مائیکرو سیٹلائٹ عدم استحکام میں نمایاں اضافہ کیا ہے (اس طرح MSI-H سے تعلق رکھتے ہیں)، لیکن مماثل مرمت کے پروٹین کی کمی نہیں ہے (لہذا dMMR نہیں)۔

اس کے علاوہ، TMB کی طرح، MSI-H بھی مائیکرو سیٹلائٹ کی عدم استحکام سے پیدا ہونے والی نئی اینٹیجن کی اقسام، نئے اینٹیجن اقسام کی میزبانی کی شناخت، اور میزبان مدافعتی نظام کی ردعمل سے متاثر ہوتا ہے۔ یہاں تک کہ MSI-H قسم کے ٹیومر میں، سنگل نیوکلیوٹائڈ اتپریورتنوں کی ایک بڑی تعداد کو مسافروں کے تغیرات (نان ڈرائیور میوٹیشن) کے طور پر شناخت کیا گیا ہے۔ لہذا، ٹیومر میں شناخت شدہ مائیکرو سیٹلائٹس کی تعداد پر مکمل انحصار کرنا کافی نہیں ہے۔ اتپریورتن کی اصل قسم (مخصوص اتپریورتن پروفائلز کے ذریعے شناخت کی گئی) اس بائیو مارکر کی پیشن گوئی کی کارکردگی کو بہتر بنا سکتی ہے۔ اس کے علاوہ، کینسر کے مریضوں کا صرف ایک چھوٹا سا حصہ MSI-H ٹیومر سے تعلق رکھتا ہے، جو زیادہ وسیع پیمانے پر قابل اطلاق بائیو مارکر کی موجودہ ضرورت کی نشاندہی کرتا ہے۔ لہذا، افادیت کی پیشن گوئی کرنے اور مریض کے انتظام کی رہنمائی کے لیے دوسرے موثر بائیو مارکر کی شناخت ایک اہم تحقیقی علاقہ ہے۔

تنظیمی بنیاد پر بائیو مارکر تحقیق

یہ دیکھتے ہوئے کہ ICI کے عمل کا طریقہ کار ٹیومر خلیوں کے اندرونی راستوں کو براہ راست نشانہ بنانے کے بجائے مدافعتی خلیوں کے دبانے کو ریورس کرنا ہے، مزید تحقیق کو ٹیومر کی نشوونما کے ماحول اور ٹیومر کے خلیوں اور مدافعتی خلیوں کے درمیان تعامل کا منظم تجزیہ کرنے پر توجہ مرکوز کرنی چاہئے، جو ICI ردعمل کو متاثر کرنے والے عوامل کو واضح کرنے میں مدد کر سکتے ہیں۔ بہت سے تحقیقی گروپوں نے مخصوص بافتوں کی اقسام کے ٹیومر یا مدافعتی خصوصیات کا مطالعہ کیا ہے، جیسے ٹیومر اور مدافعتی جین کی تبدیلی کی خصوصیات، ٹیومر اینٹیجن پریزنٹیشن خسارے، یا ملٹی سیلولر امیون سینٹرز یا ایگریگیٹس (جیسے ترتیری لیمفائیڈ ڈھانچے)، جو امیونو تھراپی کے ردعمل کی پیش گوئی کر سکتے ہیں۔

محققین نے ICI علاج سے پہلے اور بعد میں ٹیومر اور امیون ایکسوم اور مریض کے ٹشوز کے ٹرانسکروم کو ترتیب دینے کے لیے NGS کا استعمال کیا، اور مقامی امیجنگ تجزیہ کیا۔ سنگل سیل سیکوینسنگ اور اسپیشل امیجنگ، یا ملٹی اومکس ماڈلز جیسی تکنیکوں کے ساتھ مل کر متعدد مربوط ماڈلز کا استعمال کرتے ہوئے، ICI علاج کے نتائج کی پیش گوئی کرنے کی صلاحیت کو بہتر بنایا گیا ہے۔ اس کے علاوہ، ٹیومر کے مدافعتی سگنلز اور ٹیومر کی اندرونی خصوصیات کا جائزہ لینے کے لیے ایک جامع طریقہ نے بھی مضبوط پیشن گوئی کی صلاحیت کو ظاہر کیا ہے۔ مثال کے طور پر، ایک جامع بیچ کی ترتیب کا طریقہ جو بیک وقت ٹیومر اور مدافعتی خصوصیات کی پیمائش کرتا ہے ایک واحد تجزیاتی متغیر سے بہتر ہے۔ یہ نتائج زیادہ جامع انداز میں ICI کی افادیت کی تقلید کی ضرورت کو اجاگر کرتے ہیں، بشمول میزبان مدافعتی صلاحیت، اندرونی ٹیومر کی خصوصیات، اور ٹیومر کے مدافعتی اجزاء کو انفرادی مریضوں میں شامل کرنا تاکہ یہ اندازہ لگایا جا سکے کہ کون سے مریض امیونو تھراپی کا جواب دیں گے۔

بائیو مارکر ریسرچ میں ٹیومر اور میزبان عوامل کو شامل کرنے کی پیچیدگی کے ساتھ ساتھ مدافعتی مائکرو ماحولیات کی خصوصیات کے طول بلد انضمام کی ممکنہ ضرورت کے پیش نظر، لوگوں نے کمپیوٹر ماڈلنگ اور مشین لرننگ کا استعمال کرتے ہوئے بائیو مارکر کو تلاش کرنا شروع کر دیا ہے۔ فی الحال، اس میدان میں کچھ اہم تحقیقی کامیابیاں سامنے آئی ہیں، جو مشین لرننگ کی مدد سے ذاتی نوعیت کی آنکولوجی کے مستقبل کی نشاندہی کرتی ہیں۔

ٹشو بیسڈ بائیو مارکر کو درپیش چیلنجز

تجزیاتی طریقوں کی حدود۔ کچھ بامعنی بائیو مارکر ٹیومر کی مخصوص اقسام میں اچھی کارکردگی کا مظاہرہ کرتے ہیں، لیکن ضروری نہیں کہ ٹیومر کی دیگر اقسام میں۔ اگرچہ ٹیومر کی مخصوص جین کی خصوصیات میں TMB اور دیگر کے مقابلے میں زیادہ مضبوط پیشن گوئی کی صلاحیت ہوتی ہے، لیکن ان کو تمام ٹیومر کی تشخیص کے لیے استعمال نہیں کیا جا سکتا۔ NSCLC کے مریضوں کو نشانہ بنانے والی ایک تحقیق میں، جین کی تبدیلی کی خصوصیات اعلی TMB (≥ 10) کے مقابلے میں ICI کی افادیت کی زیادہ پیش گوئی کرنے والی پائی گئیں، لیکن نصف سے زیادہ مریض جین کی تبدیلی کی خصوصیات کا پتہ لگانے سے قاصر تھے۔

ٹیومر کی نسبت۔ ٹشو پر مبنی بائیو مارکر طریقہ صرف ایک ٹیومر سائٹ پر نمونے لیتا ہے، جس کا مطلب ہے کہ ٹیومر کے مخصوص حصوں کی تشخیص مریض میں تمام ٹیومر کے مجموعی اظہار کی درست عکاسی نہیں کر سکتی۔ مثال کے طور پر، مطالعات نے ٹیومر کے درمیان اور اس کے اندر PD-L1 اظہار میں متفاوت پایا ہے، اور اسی طرح کے مسائل دوسرے ٹشو مارکر کے ساتھ موجود ہیں۔

حیاتیاتی نظام کی پیچیدگی کی وجہ سے، بہت سے پہلے استعمال ہونے والے ٹشو بائیو مارکر کو زیادہ آسان بنایا گیا ہے۔ اس کے علاوہ، ٹیومر مائیکرو ماحولیات (TME) کے خلیات عام طور پر موبائل ہوتے ہیں، اس لیے مقامی تجزیہ میں دکھائے جانے والے تعاملات ٹیومر کے خلیوں اور مدافعتی خلیوں کے درمیان حقیقی تعاملات کی نمائندگی نہیں کر سکتے ہیں۔ یہاں تک کہ اگر بائیو مارکر ایک مخصوص ٹائم پوائنٹ پر ٹیومر کے پورے ماحول کی مثالی طور پر نمائندگی کر سکتے ہیں، تب بھی یہ اہداف وقت کے ساتھ ساتھ متحرک اور متحرک طور پر تبدیل ہو سکتے ہیں، جس سے یہ ظاہر ہوتا ہے کہ ایک وقت میں ایک ہی سنیپ شاٹ متحرک تبدیلیوں کی اچھی طرح سے نمائندگی نہیں کر سکتا۔

مریض کی نسبت۔ یہاں تک کہ اگر ICI مزاحمت سے متعلق معلوم جینیاتی تبدیلیوں کا پتہ چل جاتا ہے، تب بھی کچھ مریضوں کو فائدہ ہو سکتا ہے جو معروف مزاحمتی بائیو مارکر لے جاتے ہیں، ممکنہ طور پر ٹیومر کے اندر اور ٹیومر کے مختلف مقامات پر سالماتی اور/یا مدافعتی نسبت کی وجہ سے۔ مثال کے طور پر، β 2-مائکروگلوبلین (B2M) کی کمی نئی یا حاصل شدہ دوائیوں کے خلاف مزاحمت کی نشاندہی کر سکتی ہے، لیکن افراد اور ٹیومر کے درمیان B2M کی کمی کے ساتھ ساتھ ان مریضوں میں مدافعتی شناخت کے متبادل میکانزم کے تعامل کی وجہ سے، B2M کی کمی انفرادی طور پر منشیات کی پیش گوئی نہیں کر سکتی۔ لہذا، B2M کی کمی کی موجودگی کے باوجود، مریض اب بھی ICI تھراپی سے فائدہ اٹھا سکتے ہیں۔

تنظیمی بنیاد پر طول بلد بائیو مارکر
بائیو مارکر کا اظہار وقت کے ساتھ اور علاج کے اثرات کے ساتھ بدل سکتا ہے۔ ٹیومر اور امیونو بایولوجی کے جامد اور واحد جائزے ان تبدیلیوں کو نظر انداز کر سکتے ہیں، اور ٹیومر TME اور میزبان مدافعتی ردعمل کی سطح میں ہونے والی تبدیلیوں کو بھی نظر انداز کیا جا سکتا ہے۔ متعدد مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ علاج سے پہلے اور علاج کے دوران نمونے حاصل کرنے سے ICI علاج سے متعلق تبدیلیوں کی زیادہ درست شناخت ہو سکتی ہے۔ یہ متحرک بائیو مارکر تشخیص کی اہمیت کو اجاگر کرتا ہے۔

خون پر مبنی بائیو مارکر
خون کے تجزیے کا فائدہ تمام انفرادی ٹیومر کے گھاووں کو حیاتیاتی طور پر جانچنے کی صلاحیت میں مضمر ہے، مخصوص سائٹ ریڈنگ کے بجائے اوسط ریڈنگ کی عکاسی کرتا ہے، یہ علاج سے متعلق متحرک تبدیلیوں کا جائزہ لینے کے لیے خاص طور پر موزوں بناتا ہے۔ متعدد تحقیقی نتائج سے پتہ چلتا ہے کہ گردش کرنے والے ٹیومر DNA (ctDNA) یا گردش کرنے والے ٹیومر سیل (CTC) کا استعمال کم سے کم بقایا بیماری (MRD) کا جائزہ لینے کے لیے علاج کے فیصلوں کی رہنمائی کر سکتا ہے، لیکن ان ٹیسٹوں میں یہ پیش گوئی کرنے کے بارے میں محدود معلومات ہیں کہ آیا مریض ICI جیسی امیونو تھراپی سے فائدہ اٹھا سکتے ہیں۔ لہذا، مدافعتی ایکٹیویشن یا میزبان مدافعتی صلاحیت کی پیمائش کرنے کے لیے ctDNA ٹیسٹنگ کو دوسرے طریقوں کے ساتھ جوڑنے کی ضرورت ہے۔ اس سلسلے میں، پیریفرل بلڈ مونو نیوکلیئر سیلز (PBMCs) کی امیونو فینوٹائپنگ اور ایکسٹرا سیلولر ویسیکلز اور پلازما کے پروٹومک تجزیہ میں پیش رفت ہوئی ہے۔ مثال کے طور پر، پیریفرل امیون سیل ذیلی قسمیں (جیسے CD8+T خلیات)، مدافعتی چیک پوائنٹ کے مالیکیولز کا اعلی اظہار (جیسے پیریفرل CD8+T خلیات پر PD1)، اور پلازما میں مختلف پروٹینوں کی بلند سطح (جیسے CXCL8، CXCL10، IL-6، IL-10، IL-10، IL-10، IL-10، IL-6، IL-10، IL-10، تمام مؤثر خدمات)۔ سی ٹی ڈی این اے ڈائنامک کو بائیو مارکر کے لیے سپلیمنٹس۔ ان نئے طریقوں کا فائدہ یہ ہے کہ وہ ٹیومر کے اندر ہونے والی تبدیلیوں کا جائزہ لے سکتے ہیں (سی ٹی ڈی این اے کی طرف سے پائی جانے والی تبدیلیوں کی طرح) اور مریض کے مدافعتی نظام میں ہونے والی تبدیلیوں کو بھی ظاہر کر سکتے ہیں۔

ریڈیومکس
تصویری اعداد و شمار کے پیش گوئی کرنے والے عوامل ٹشو بائیو مارکر کے نمونے لینے اور بایپسی کی حدود کو مؤثر طریقے سے دور کر سکتے ہیں، اور کسی بھی وقت پورے ٹیومر اور ممکنہ دیگر میٹاسٹیٹک سائٹس کا مشاہدہ کر سکتے ہیں۔ لہذا، وہ مستقبل میں غیر حملہ آور متحرک بائیو مارکر کا ایک اہم حصہ بن سکتے ہیں۔ ڈیلٹا ریڈیومکس مختلف اوقات میں ٹیومر کی متعدد خصوصیات (جیسے ٹیومر کے سائز) میں ہونے والی تبدیلیوں کا مقداری حساب لگا سکتا ہے، جیسے کہ ICI علاج سے پہلے اور بعد میں، علاج کے دوران، اور اس کے بعد کی پیروی۔ ڈیلٹا ریڈیومکس نہ صرف ابتدائی علاج کے ابتدائی یا کوئی ردعمل کی پیشین گوئی نہیں کر سکتے ہیں بلکہ حقیقی وقت میں ICI کے خلاف حاصل شدہ مزاحمت کی بھی نشاندہی کر سکتے ہیں اور مکمل معافی کے بعد کسی بھی تکرار کی نگرانی کر سکتے ہیں۔ مشین لرننگ ٹکنالوجی کے ذریعے تیار کیا گیا امیجنگ ماڈل علاج کے ردعمل اور ممکنہ منفی واقعات کی پیش گوئی کرنے میں روایتی RECIST معیار سے بھی بہتر ہے۔ موجودہ تحقیق سے پتہ چلتا ہے کہ ان ریڈیومکس ماڈلز میں مدافعتی تھراپی کے ردعمل کی پیشن گوئی کرنے میں 0.8 سے 0.92 تک وکر (AUC) کا رقبہ ہے۔

ریڈیومکس کا ایک اور فائدہ یہ ہے کہ اس کی چھدم ترقی کی درست شناخت کرنے کی صلاحیت ہے۔ مشین لرننگ کے ذریعے بنایا گیا ریڈیومکس ماڈل ہر ٹیومر کے لیے CT یا PET ڈیٹا کی دوبارہ پیمائش کر کے صحیح اور غلط ترقی کے درمیان مؤثر طریقے سے فرق کر سکتا ہے، بشمول شکل، شدت، اور ساخت جیسے عوامل، 0.79 کے AUC کے ساتھ۔ یہ ریڈیومکس ماڈل مستقبل میں بیماری کے بڑھنے کے بارے میں غلط فہمی کی وجہ سے علاج کے قبل از وقت ختم ہونے سے بچنے کے لیے استعمال کیے جا سکتے ہیں۔

آنتوں کا مائکرو بائیوٹا
گٹ مائکرو بائیوٹا کے بائیو مارکر سے توقع کی جاتی ہے کہ وہ ICI کے علاج معالجے کی پیش گوئی کریں گے۔ متعدد مطالعات سے پتہ چلتا ہے کہ ایک مخصوص گٹ مائکرو بائیوٹا کا ICI علاج کے مختلف قسم کے کینسر کے ردعمل سے گہرا تعلق ہے۔ مثال کے طور پر، میلانوما اور جگر کے کینسر کے مریضوں میں، رومینوکوکاسائی بیکٹیریا کی کثرت PD-1 امیونو تھراپی ردعمل سے وابستہ ہے۔ جگر کے کینسر، پھیپھڑوں کے کینسر، یا رینل سیل کارسنوما کے مریضوں میں Akkermansia muciniphila کی افزودگی عام ہے، جو ICI علاج کے لیے اچھی طرح سے جواب دیتے ہیں۔

اس کے علاوہ، نیا مشین لرننگ ماڈل ٹیومر کی اقسام سے آزاد ہو سکتا ہے اور مخصوص گٹ بیکٹیریل جنرا کو امیونو تھراپی کے علاج کے ردعمل کے ساتھ منسلک کر سکتا ہے۔ دیگر مطالعات نے اس مخصوص کردار کا بھی انکشاف کیا ہے جو انفرادی بیکٹیریل گروپ میزبان مدافعتی نظام کو منظم کرنے میں ادا کرتے ہیں، مزید یہ دریافت کرتے ہیں کہ کینسر کے خلیوں کے مدافعتی فرار کو کیسے روکا جائے یا اسے فروغ دیا جائے۔

Neoadjuvant تھراپی
ٹیومر حیاتیات کی متحرک تشخیص بعد میں طبی علاج کی حکمت عملیوں کی رہنمائی کر سکتی ہے۔ neoadjuvant تھراپی کا ٹرائل جراحی کے نمونوں میں پیتھولوجیکل معافی کے ذریعے علاج کے اثر کا اندازہ کر سکتا ہے۔ میلانوما کے علاج میں، بنیادی پیتھولوجیکل رسپانس (MPR) تکرار سے پاک بقا کی شرح سے وابستہ ہے۔ PRADO ٹرائل میں، محققین مریض کے مخصوص پیتھولوجیکل معافی کے اعداد و شمار کی بنیاد پر اگلے طبی مداخلت کے اقدامات، جیسے سرجری اور/یا معاون علاج کا تعین کرتے ہیں۔

کینسر کی مختلف اقسام میں سے، کئی نئے معاون علاج کے اختیارات میں اب بھی سر سے موازنہ کرنے کی کمی ہے۔ لہذا، امیونو تھراپی مونو تھراپی یا مجموعہ تھراپی کے درمیان انتخاب کا فیصلہ اکثر حاضری دینے والے معالج اور مریض کے ذریعہ مشترکہ طور پر کیا جاتا ہے۔ فی الحال، محققین نے ایک انٹرفیرون گاما (IFN گاما) کی خصوصیت تیار کی ہے جس میں بائیو مارکر کے طور پر 10 جین شامل ہیں جو کہ neoadjuvant تھراپی کے بعد میلانوما میں پیتھولوجیکل معافی کی پیش گوئی کرنے کے لیے ہیں۔ انہوں نے ان خصوصیات کو ایک الگورتھم میں مزید مربوط کیا تاکہ نیواڈجوانٹ تھراپی کے لیے مضبوط یا کمزور ردعمل والے مریضوں کو منتخب کیا جا سکے۔ DONIMI نامی ایک فالو اپ مطالعہ میں، محققین نے اس اسکور کو، زیادہ پیچیدہ تجزیہ کے ساتھ استعمال کیا، نہ صرف علاج کے ردعمل کی پیش گوئی کرنے کے لیے، بلکہ یہ بھی تعین کرنے کے لیے کہ کون سے مرحلے III میلانوما کے مریضوں کو ہسٹون ڈیسیٹیلیز انحیبیٹرز (HDACi) کے اضافے کی ضرورت ہے تاکہ نیواڈجوانٹ ICI علاج کے ردعمل کو بڑھایا جا سکے۔

مریضوں سے حاصل کردہ ٹیومر ماڈل
وٹرو ٹیومر کے ماڈلز میں مریض کے مخصوص ردعمل کی پیش گوئی کرنے کی صلاحیت ہوتی ہے۔ ان وٹرو پلیٹ فارم کے برعکس جو ہیماٹولوجک خرابی کے منشیات کے ردعمل کے سپیکٹرم تجزیہ کے لیے استعمال کیا جاتا ہے، ٹھوس ٹیومر کو ان کے منفرد ٹیومر مائیکرو اسٹرکچر اور ٹیومر کے مدافعتی تعامل کی وجہ سے زیادہ چیلنجز کا سامنا کرنا پڑتا ہے۔ سادہ ٹیومر سیل کلچر ان پیچیدہ خصوصیات کو آسانی سے نقل نہیں کر سکتا۔ اس صورت میں، مریضوں سے پیدا ہونے والے اعضاء یا اعضاء کے چپس جیسے ٹیومر ان ساختی حدود کی تلافی کر سکتے ہیں، کیونکہ وہ اصل ٹیومر سیل کی ساخت کو محفوظ رکھ سکتے ہیں اور مریض کے مخصوص انداز میں ICI ردعمل کا اندازہ کرنے کے لیے لمفائیڈ اور مائیلوڈ مدافعتی خلیات کے ساتھ تعاملات کی تقلید کر سکتے ہیں، اس طرح تین حقیقی حیاتیاتی ماحول میں زیادہ درست طریقے سے دوبارہ پیدا ہونے والی خصوصیات۔

چین اور ریاستہائے متحدہ میں کئی پیش رفت مطالعات نے اس نئے ہائی فیڈیلیٹی تھری ڈائمینشنل ان وٹرو ٹیومر ماڈل کو اپنایا ہے۔ نتائج سے پتہ چلتا ہے کہ یہ ماڈل پھیپھڑوں کے کینسر، بڑی آنت کے کینسر، چھاتی کے کینسر، میلانوما اور دیگر ٹیومر کے آئی سی آئی کے ردعمل کی مؤثر انداز میں پیش گوئی کر سکتے ہیں۔ یہ ان ماڈلز کی پیشین گوئی کی کارکردگی کو مزید تصدیق اور معیاری بنانے کی بنیاد رکھتا ہے۔